化糞池清理雖說不是特別復雜的事情，但也需要必備一些專業知識和專用的工具，并需要賬務標準化的操作流程。否則不要輕易動手清理化糞池，化糞池清理且有較大的危險性。
清理化糞池過程如下：
   (1)首先需要簽訂清掏清掏合同，制定清掏清理方案。
   (2)在準備好清掏設備(如：吸污吸糞車)。
   (3)用鐵鉤打開化糞池的蓋板，再用長的桿子(如竹桿)攪散化糞池內雜物結塊層。

   (4)套好吸污車的吸糞膠管放入化糞池內。

   (5)啟動吸糞車的開關，吸出糞便直至化糞池內的化糞結塊物吸完為止，防止弄臟工作現場和過往行人的衣物。
   (6)化糞池內的沉淀物清理完畢后，蓋好化糞池井蓋，用清水沖洗工作現場和所有工具。
建議：
   (1)化糞池每年至少清理一次(有些化糞池每季度都需要清理一次)。
   (2)清理后，目視井內無積物浮于上面，出入口暢通，保持污水不溢出地面。
   (3)在化糞池井蓋打開后10～15min，人不站在池邊，禁止在池邊點火或吸煙，以防沼氣著火燒傷人。
   (4)清理人員不要隨便下池，防止人員中毒或陷入水中。
   (5)化糞池井蓋打開后工作員不能離開現場，清潔完畢后，隨手蓋好井蓋，以防行人掉入井內發生意外。